본 연구는 거래소기법과 코스닥기업간에 회계이익과 과세소득의 차이가 다른지를 실증적으로 분석하였다. 또한 회계이익과 과세소독의 차이가 기업지배구조에 따라 두 시장간에 다른지를 분석하였다. Clody et at.(1996)에 의하면, 주식공개기업은 주식비공개 기업에 비해 자본시장압력이 상대적으로 높다고 보고하였다. 자본시장압력이 높으면 기업의 경영자는 과세소득보다 회계이익을 증가시켜 보고할 유인이 존재한다. 본 연구에서의 표본은 거래소기업과 코스닥기업으로 모두 주식이 공개된 기업들이다. 그러나 같은 주식공개 기업이라도 두 시장간에 자본시장압력에는 차이가 있을 것으로 기대된다. 본 연구의 목적은 거래소기업과 코스닥기업의 실제 과세소득 자료를 사업보고서상 법인세등 명세서에서 수집하여 이들 두시장간 회계이익과 과세소득의 차이를 비교하여 분석하고, 거래소기업과 코스닥기업의 기업지배구조에 따라 특히, 최대주주 지분율에 따라 두 시장간에 회계이익과 과세소득의 차이가 다른지를 비교하여 분석하는데 있다. 본 연구는 1999년과 2000년에 거래소와 코스닥시장에 상장·등록되어 있는 기업들을 분석대상으로 하였다. 표본은 금융업을 제외한 12월 결산법인을 대상으로 거래소기업 498개 기업-연 자료와 코스닥기업 513개 기업-연 자료를 이용하였다. 실증분석결과에 의하면, 첫째로 거래소기업에 비해 코스닥기업이 회계이익과 과세소득의 차이가 유의한 양(누)의 차이가 있는 것으로 나타났다 즉, 거래소기업에 비해 코스닥기업이 과세소득보다 회계이익을 높게 보고하는 경향이 강하고, 코스닥기업에 비해 거래소기업은 회계이익을 과세소득과 일치시켜 보고하늘 경향이 강한 것으로 나타났다. 이러한 결과는 거래소기업에 비해 코스닥기업의 경우 자본시장압력이 보다 더 높다는 젓을 시사한다. 둘째로 전체기업의 경우 회계이익과 과세소득의 차이와 최대주주 지분율간에 유의한 양(+)의 관련성이 있는 것으로 나타났다 또한 이러한 결과는 거래소기업에 비해 코스닥기업의 경우에 최대주주 지분율이 증가할수록 더 뚜렷한 양(+)의 관련성이 있는 것으로 관찰되었다. 본 연구결과에 따르면, 거래소기업과 코스닥기업의 시장간 차이 및 기업지배구조 특히, 최대주주 지분율에 따라서 회계이익과 과세소득의 차이가 다른 것으로 나타났다.